根据《盗墓笔记》相关剧情，吴邪大学期间就读于 建筑系 ，以下是相关原文依据：
专业背景
在多次解谜和探险场景中，吴邪展现了卓越的建筑知识，例如分析古墓结构、机关构造等。例如在《盗墓笔记》第一章中提到：“吴邪在大学里读的是建筑系，多次运用建筑知识分析墓室结构或机关构造”。
相关情节佐证
他在大学期间就开始接触古董和建筑相关的工作，毕业后进入房地产企业从事工程类工作；
书中明确标注其毕业院校为 浙江大学建筑系 （第四章）。
综上，吴邪大学专业为 建筑系 ，这一设定为其后续的盗墓冒险活动提供了重要知识储备。
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