上海海事大学开设的专业有交通管理、会计学、外国语言文学类、工业设计、材料科学与工程、电子信息类、船舶与海洋工程、管理科学与工程类等，具体完整专业请看下表。
| 专业 | 科类 |
| 交通管理(航运管理) | 文理综合 |
| 交通管理（航运管理）新国航班 | 文理综合 |
| 交通运输类（大类招生） | 文理综合 |
| 交通运输（国际班） | 文理综合 |
| 会计学 | 文理综合 |
| 会计学（国会班） | 文理综合 |
| 外国语言文学类（大类招生） | 文理综合 |
| 安全科学与工程类（大类招生） | 文理综合 |
| 工业设计 | 文理综合 |
| 工商管理类（大类招生)（农村专项） | 文理综合 |
| 工商管理类（大类招生） | 文理综合 |
| 数学类（大类招生） | 文理综合 |
| 机械类（中外合作）（机械电子工程） | 文理综合 |
| 机械类（大类招生） | 文理综合 |
| 材料科学与工程 | 文理综合 |
| 法学（海商法） | 文理综合 |
| 法学（海商法）（卓越法律人才班) | 文理综合 |
| 港口航道与海岸工程 | 文理综合 |
| 物流管理 | 文理综合 |
| 物流管理与工程类（大类招生） | 文理综合 |
| 电子信息类（大类招生)（农村专项） | 文理综合 |
| 电子信息类（大类招生） | 文理综合 |
| 电气类（中外合作）（电气工程与智能控制） | 文理综合 |
| 电气类（大类招生） | 文理综合 |
| 管理科学与工程类（大类招生） | 文理综合 |
| 经济学类(大类招生） | 文理综合 |
| 经济学类（大类招生)（农村专项） | 文理综合 |
| 绘画（中国画） | 文理综合 |
| 绘画（油画） | 文理综合 |
| 能源与动力工程 | 文理综合 |
| 航海技术 | 文理综合 |
| 船舶与海洋工程 | 文理综合 |
| 船舶电子电气工程 | 文理综合 |
| 视觉传达设计 | 文理综合 |
| 计算机类（大类招生)（农村专项） | 文理综合 |
| 计算机类（大类招生） | 文理综合 |
| 轮机工程 | 文理综合 |
重点学科国家重点（培育）学科：
交通运输规划与管理（隶属交通运输学院）
交通部重点学科
| 学科名称 | 所属院系 |
| 产业经济学 | 经济管理学院 |
| 交通运输规划与管理 | 交通运输学院 |
上海市重点学科
| 学科名称 | 所属院系 |
| 载运工具运用工程 | 商船学院 |
| 交通运输规划与管理 | 交通运输学院 |
| 物流管理与工程 | 物流工程学院 |
| 港口机械电子工程 | 物流工程学院 |
| 国际法学（海商法） | 法学院 |
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