1、分级不同
二本A类好于二本B类院校，虽然，两者在学历上都是二本本科学历，但是，本科教育院校是分为“重点本科高校”与“普通本科高校”。
2、侧重不同
“重点本科高校”与“普通本科高校”只是侧重不同，无本质差别，前者非常注重理论研究，后者更注重理论实践应用。
3、办学制度不同
A类院校为一般公办本科院校；B类院校为本科院校分校或近几年国家批准从专科升为本科的院校，一般是民办三本大学或者独立学院。
4、公私区别
本科A类及以上的是公立大学，而相对来说,本科B类就是私立大学了。
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普通二本大学只是个模糊的概念，指的是录取批次放在第二批的大学，每个省的情况都不大一样。比如安徽理工大学，在外省是放在普通二本批次录取的，但是在安徽本省和几个指定省份就是一本（包括重点一本、普通一本）录取，
又如西南财经大学天府学院是一所财经独立学院，在四川，山东，福建，上海等省市招收本科第二批次考生，其它省份招收三批考生，所以西南财经大学天府学院也是二本。此类二本学院还有“长春建筑学院”。
但是总体上来说，一本大学（包括重点一本、普通一本）大都是部委直属大学或者“211工程”大学，而普通二本大学大多为省属大学或者非“211工程”大学，二者在师资、硬件等方面还是有一定差距的。这也是为什么大家都追捧一本大学的主要原因。
但是相对来说，考上一本大学的学生毕竟是少数，更多的同学读的是普通二本、普通三本大学。纵观全国的高考形势，重点大学停止扩招而高考报名人数不断攀升，预示着普通二本、普通三本大学将成为高考战场上的热点。
科高考入取批次的不同，本科123本叫法称呼的不同，本科办学等级（部属、省属、市属）的不同、本科办学体制以及性质（公办、民办）的不同，由办学体制决定的本科学费高低的不同，
本科（123本）各大学毕业证书“本簿和颜色”的相同与不同与本科高校的层次和“学历、文凭”水平的高低无关，所以123本高校是具有相同本科学历和文凭的高校，只是侧重不同，
重点本科高校（985、211高校）重理论研究，普通本科高校（普通123本高校）重理论应用即重点本科重研究，普通本科重应用。
参考资料
广东省的二本B类大学有：
东莞 广东科技学院
佛山du 广东东软学院(原南zhi海东软信息技术职业学dao院)
广州 广东白云学院
广州 广东培正学院
广州 华南理工大学广州学院
广州 广州大学华软学院
广州 中山大学南方学院
广州 广东外语外贸大学南国商学院
广州 广东财经大学华商学院
广州 华南农业大学珠江学院
广州 广东技术师范学院天河学院
广州 广东工业大学华立学院
广州 广州大学松田学院
广州 广州商学院(原华南师范大学增城学院)
广州 广州工商学院(原广州工商职业技术学院)
广州 中山大学新华学院
广州 广州商学院(原华南师范大学增城学院)
湛江 广东海洋大学寸金学院
表示本科二批B阶段，是其他一般本科院校和本市部分本科三批院校的部分专业。
第二批A类是公办本科院校，第二批B类是民办本科院校。第二批本科A类先于第二批本科B类录取，录取分较高。但二者之间文凭都是一样的，都属于本科。第二批A类与第二批B类最大的区别在于学费问题上。
第二批A类的学费要比第二批B类高很多。第二批A类属于热门公办学校，这类学校录取优先投档，没被A类学校录取的，只能在本科第二批B类民办院校投档。第二批A类院校条件设施好，第二批本科B类的学校专业比较冷门。
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注意
高校招生录取中，存在一种所谓“大小年”的现象，即部分院校录取分数线偶尔出现隔年上下波动的现象，某一年填报该校的人数比招生计划数高出许多，导致当年该校的录取分数线可能被抬得较高，这一年称为“大年”。
由于这一年录取分数线较高，竞争较激烈，所以下一年有些考生便望而却步，不再报考该校，该校的录取分数线就可能相应降下来，这一年称为“小年”。如此循环，报考人数和录取分数线起伏比较明显，就形成了所谓的“大小年”现象。
提醒考生注意，“大小年”现象并无绝对的科学依据和规律，切勿盲从。对于实行平行志愿的批次，由于考生人数分布更趋于稳定，“大小年”现象在很大程度上已得到缓解，如今该现象多呈偶发和不规律出现的状态。
二本分为A类和B类，没有二本C类的说法。
二本A类：是指公办本科院校，有一定的知名度，在院校实力上更占优势一些，而且录取分数线要高于B类。
二本B类：是指民办院校和独立学院，是近几年由专科升为本科的院校，被称之为二本B类，其录取分数线要低于A类。
本科录取批次的区别
普通本科院校分二批录取。
第一批分A类、A1类和B类院校：
A类是教育部确定的一流大学建设高校、一流学科建设高校的一流学科涵盖的专业、2018年在我省列入本科批次的院校；
A1类是第一批A类院校中部分中外合作办学的院校；
B类是多年来在我省招生生源较好的一般院校。
第二批分为A类、B类和C类三类院校：
A类院校为一般本科院校；
B类院校为本科院校分校或近几年国家教育部批准从专科升为本科的院校；
C类院校为独立学院、民办院校。
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