学生在校学习期间，有下列情况之一的，可以转专业：
（一）学生确有特长，转专业、转学更能发挥其特长的； 这种情况一般要求你大一第一学期绩点高，成绩好。学校会有转专业机会，需要面试。
（二）学生入学后发现某种疾病或生理缺陷，经学校指定的医疗单位诊断确认，不能在原专业学习，但尚能在本校或其他高等学校相关专业学习的；
（三）经学校认可，学生确有某种特殊困难，不转专业或不转学则无法继续学习的；
（四）本科学生学习确有困难，要求转入专科学习的；
（五）根据就业形势和社会对人才需求情况，学校认为确实有必要调整少量学生专业的。
| 学院 | 专业 |
| 药学院 | 药学、药物制剂、药物分析、国家理科基础药学基地班（八年制本硕博连读） 药学（日语强化班，五年制、药学（英语强化班，五年制） 药学（专升本） |
| 制药工程学院 | 制药工程、环境科学、应用化学、药物化学 |
| 中药学院 | 中药学、中药资源与开发、药学（食品药学）、中药制药、葡萄与葡萄酒工程 中药学（日语强化班，五年制） |
| 生命科学与生物技术制药学院 | 生物工程、临床药学（五年制）、生物技术制药 生命科学与技术基地班（六年制本硕连读；前两年半在吉林大学进行基础科目学习，第六学期回该校进行研究生课程学习） |
| 工商管理学院 | 工商管理、市场营销、国际贸易与经济、药事管理 市场营销（专升本） |
| 医疗器械学院 | 生物医学工程 |
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