报考专业应该从自己的实际出发，量体裁衣，准确地为自己定位，认清形势与自身实力，才能做出理性选择，使成功概率最大化，不要轻易相信一些所谓考研热门专业新兴专业，热门也会有饱和考研时候也会冷却，何况竞争激烈，兴趣是最好的老师，因此对于考研专业选择要以兴趣为导向。以下是整理的南京医科大学专业排行榜，仅供参考。
| 1 | 临床医学 | 4.4(210人) |
| 2 | 口腔医学 | 4.7(140人) |
| 3 | 预防医学 | 4.5(109人) |
| 4 | 康复治疗学 | 4.4(108人) |
| 5 | 医学影像学 | 4.5(90人) |
| 6 | 公共事业管理 | 4.3(69人) |
度国家级一流本科专业建设点名单
| 序号 | 专业名称 | 类别 |
| 1 | 生物医学工程 | 国家级 |
| 2 | 临床医学 | 国家级 |
| 3 | 儿科学 | 国家级 |
| 4 | 口腔医学 | 国家级 |
| 5 | 预防医学 | 国家级 |
| 6 | 药学 | 国家级 |
| 7 | 眼视光学 | 国家级 |
| 8 | 护理学 | 国家级 |
度省级一流本科专业建设点名单
| 序号 | 专业名称 | 类别 |
| 1 | 应用统计学 | 省级 |
| 2 | 法医学 | 省级 |
| 3 | 基础医学 | 省级 |
| 4 | 医学影像学 | 省级 |
| 5 | 临床药学 | 省级 |
| 6 | 康复治疗学 | 省级 |
| 7 | 卫生检验与检疫 | 省级 |
| 8 | 医学检验技术 | 省级 |
| 9 | 生物信息学 | 省级 |
| 10 | 公共事业管理 | 省级 |
国家特色专业：护理学、口腔医学、康复治疗学、临床医学、预防医学
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