学生在校学习期间，有下列情况之一的，可以转专业：
（一）学生确有特长，转专业、转学更能发挥其特长的； 这种情况一般要求你大一第一学期绩点高，成绩好。学校会有转专业机会，需要面试。
（二）学生入学后发现某种疾病或生理缺陷，经学校指定的医疗单位诊断确认，不能在原专业学习，但尚能在本校或其他高等学校相关专业学习的；
（三）经学校认可，学生确有某种特殊困难，不转专业或不转学则无法继续学习的；
（四）本科学生学习确有困难，要求转入专科学习的；
（五）根据就业形势和社会对人才需求情况，学校认为确实有必要调整少量学生专业的。
| 南京农业大学农学院 | 农学、种子科学与工程、金善宝实验班（植物生产方向） |
| 南京农业大学植物保护学院 | 植物保护 |
| 南京农业大学资源与环境科学学院 | 农业资源与环境、环境科学、生态学、环境工程 |
| 南京农业大学园艺学院 | 园艺、园林、风景园林、中药学、设施农业科学与工程 |
| 南京农业大学动物科技学院 | 动物科学、水产养殖学 |
| 南京农业大学动物医学院 | 动物医学、动物药学 |
| 南京农业大学经济管理学院 | 农林经济管理、国际经济与贸易、市场营销、电子商务、 |
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| 南京农业大学信息科学技术学院 | 信息管理与信息系统、计算机科学与技术、网络工程 |
| 南京农业大学公共管理学院 | 土地资源管理、行政管理、人文地理与城乡规划、人力资源管理、劳动与社会保障 |
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| 南京农业大学人文与社会发展学院 | 旅游管理、公共事业管理、法学、社会学、农村区域发展、表演 |
| 南京农业大学理学院 | 信息与计算科学、应用化学、统计学 |
| 南京农业大学生命科学学院 | 生物科学、生物技术 |
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| 南京农业大学工学院 | 农业机械化及其自动化、交通运输、工业设计、机械设计制造及其自动化、农业电气化、电子信息科学与技术、自动化、工业工程、工程管理、物流工程、车辆工程、材料成型及控制工程 |
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