南京的大学有南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、南京工业大学、南京邮电大学、河海大学、南京林业大学、南京信息工程大学、南京农业大学等。
| 学校名称 | 办学层次 | 备注 |
| 南京大学 | 本科 | 公办 |
| 东南大学 | 本科 | 公办 |
| 南京航空航天大学 | 本科 | 公办 |
| 南京理工大学 | 本科 | 公办 |
| 南京工业大学 | 本科 | 公办 |
| 南京邮电大学 | 本科 | 公办 |
| 河海大学 | 本科 | 公办 |
| 南京林业大学 | 本科 | 公办 |
| 南京信息工程大学 | 本科 | 公办 |
| 南京农业大学 | 本科 | 公办 |
| 南京医科大学 | 本科 | 公办 |
| 南京中医药大学 | 本科 | 公办 |
| 中国药科大学 | 本科 | 公办 |
| 南京师范大学 | 本科 | 公办 |
| 南京财经大学 | 本科 | 公办 |
| 江苏警官学院 | 本科 | 公办 |
| 南京体育学院 | 本科 | 公办 |
| 南京艺术学院 | 本科 | 公办 |
| 南京工程学院 | 本科 | 公办 |
| 南京审计大学 | 本科 | 公办 |
| 南京晓庄学院 | 本科 | 公办 |
| 南京特殊教育师范学院 | 本科 | 公办 |
| 南京森林警察学院 | 本科 | 公办 |
| 金陵科技学院 | 本科 | 公办 |
| 江苏第二师范学院 | 本科 | 公办 |
| 三江学院 | 本科 | 民办 |
| 东南大学成贤学院 | 本科 | 民办 |
| 南京大学金陵学院 | 本科 | 民办 |
| 南京理工大学紫金学院 | 本科 | 民办 |
| 南京航空航天大学金城学院 | 本科 | 民办 |
| 中国传媒大学南广学院 | 本科 | 民办 |
| 南京工业大学浦江学院 | 本科 | 民办 |
| 南京师范大学中北学院 | 本科 | 民办 |
| 南京信息工程大学滨江学院 | 本科 | 民办 |
| 南京审计大学金审学院 | 本科 | 民办 |
| 南京工业职业技术学院 | 专科 | 公办 |
| 江苏经贸职业技术学院 | 专科 | 公办 |
| 江苏联合职业技术学院 | 专科 | 公办 |
| 江苏海事职业技术学院 | 专科 | 公办 |
| 南京交通职业技术学院 | 专科 | 公办 |
| 南京科技职业学院 | 专科 | 公办 |
| 南京铁道职业技术学院 | 专科 | 公办 |
| 南京信息职业技术学院 | 专科 | 公办 |
| 江苏城市职业学院 | 专科 | 公办 |
| 南京城市职业学院 | 专科 | 公办 |
| 南京机电职业技术学院 | 专科 | 公办 |
| 南京旅游职业学院 | 专科 | 公办 |
| 江苏卫生健康职业学院 | 专科 | 公办 |
| 应天职业技术学院 | 专科 | 民办 |
| 正德职业技术学院 | 专科 | 民办 |
| 钟山职业技术学院 | 专科 | 民办 |
| 金肯职业技术学院 | 专科 | 民办 |
| 南京视觉艺术职业学院 | 专科 | 民办 |
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