温州共有6所本科大学，名单分别为温州医科大学、温州大学、温州医科大学仁济学院、温州大学瓯江学院、温州商学院、温州肯恩大学，具体完整本科大学名单见下表。
| 序号 | 学校名称 | 主管部门 | 所在地 | 办学层次 | 备注 |
| 1 | 温州医科大学 | 浙江省 | 温州市 | 本科 | |
| 2 | 温州大学 | 浙江省 | 温州市 | 本科 | |
| 3 | 温州医科大学仁济学院 | 浙江省教育厅 | 温州市 | 本科 | 民办 |
| 4 | 温州大学瓯江学院 | 浙江省教育厅 | 温州市 | 本科 | 民办 |
| 5 | 温州商学院 | 浙江省教育厅 | 温州市 | 本科 | 民办 |
| 6 | 温州肯恩大学 | 浙江省教育厅 | 温州市 | 本科 | 中外合作办学 |
温州医科大学是浙江省省属普通高等学校。学校可溯源至创办于1912年的浙江医学专门学校，1958年8月由浙江医学院从杭州分迁至温州建立，初名“浙江第二医学院”，后以校址所在地定名为“温州医学院”，2013年更名为“温州医科大学”，2015年成为浙江省政府、国家卫生计生委和教育部共建高校。2017年，成为浙江省重点建设高校。
学校1958年开始招收五年制本科学生，1978年招收硕士研究生，是全国首批硕士学位授予单位，具有博士学位授予权。现有临床医学、基础医学、药学、生物医学工程一级学科博士点和临床医学专业学位博士点，临床医学、护理学、中药学、生物学、生物医学工程、基础医学、中西医结合、药学、医学技术、口腔医学、公共卫生与预防医学、公共管理等12个一级学科硕士点，临床医学、生物医学工程、口腔医学、护理、公共管理、药学、公共卫生、应用心理等8个专业硕士学位授权点；设有临床医学一级学科博士后科研流动站。
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