温州医科大学重点专业有临床医学、眼视光学、药学、医学检验，其中临床医学专业是研究疾病的病因、诊断、治疗和预后，提高临床治疗水平，促进人体健康的科学。
| 国家特色专业 | 临床医学 眼视光学 药学 医学检验 |
| 类别 | 专业名称 |
|---|---|
| 生物科学类(本) | 生物技术 |
| 心理学类(本) | 应用心理学 |
| 生物医学工程类(本) | 生物医学工程 |
| 生物工程类(本) | 生物制药 |
| 临床医学类(本) | 临床医学 眼视光医学 精神医学 儿科学 麻醉学 医学影像学 眼视光医学（5+3一体化） 临床医学（5+3一体化） 临床医学中外合作办学 放射医学 临床医学（5+3一体化，儿科学方向） |
| 口腔医学类(本) | 口腔医学 |
| 公共卫生与预防医学类(本) | 预防医学 |
| 中医学类(本) | 中医学 |
| 药学类(本) | 临床药学 药学 |
| 中药学类(本) | 中药学 |
| 医学技术类(本) | 眼视光学 医学影像技术 康复治疗学 医学检验技术 卫生检验与检疫 |
| 护理学类(本) | 护理学 助产学 |
| 管理科学与工程类(本) | 信息管理与信息系统 |
| 工商管理类(本) | 市场营销 |
| 公共管理类(本) | 公共事业管理 劳动与社会保障 |
| 护理类(专) | 护理 |
| 医学技术类(专) | 眼视光技术 |
| 其他(本) | 医学检验 |
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