根据南京航空航天大学最新招生计划数据查询，南京航空航天大学开设专业有工程力学、建筑环境与能源应用工程、飞行器环境与生命保障工程、飞行器设计与工程、探测制导与控制技术、电气工程及其自动化、自动化、生物医学工程、测控技术与仪器、能源与动力工程等，具体完整专业名单见下表。
| 院系设置 | 所有专业 |
|---|---|
| 航空学院 | 工程力学，建筑环境与能源应用工程，飞行器环境与生命保障工程，飞行器设计与工程 |
| 自动化学院 | 探测制导与控制技术，电气工程及其自动化，自动化，生物医学工程，测控技术与仪器 |
| 能源与动力学院 | 能源与动力工程，飞行器动力工程，车辆工程 |
| 电子信息工程学院 | 信息工程，微电子科学与工程，电子信息科学与技术 |
| 经济与管理学院 | 市场营销，会计学，电子商务，国际经济与贸易，金融学，工商管理，工业工程，信息管理与信息系统 |
| 材料科学与技术学院 | 核工程与核技术，新能源材料与器件，材料科学与工程，辐射防护与核安全，应用化学 |
| 机电学院 | 工业设计，飞行器制造工程(航空维修工程与技术)，机械工程，飞行器制造工程 |
| 民航学院/飞行学院 | 飞行技术，土木工程，交通运输，飞行器适航技术 |
| 外国语学院 | 日语，英语 |
| 航天学院 | 飞行器控制与信息工程，光电信息科学与工程，航空航天工程 |
| 理学院 | 光电信息科学与工程，信息与计算科学，应用物理学 |
| 人文与社会科学学院 | 公共事业管理，法学，政治学与行政学 |
| 艺术学院 | 戏剧影视美术设计，音乐表演（歌舞），环境设计，广播电视学 |
| 计算机科学与技术学院/人工智能学院 | 计算机科学与技术，信息安全，物联网工程，软件工程 |
| 国际教育学院 | 自动化 |
| 长空学院 | 航空航天类 |
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