哈尔滨工程大学有2个校区，分别是哈尔滨工程大学青岛校区。哈尔滨工程大学本部。
哈尔滨工程大学本部：黑龙江省哈尔滨市南岗区南通大街145号
青岛校区：2016年8月30日，青岛市人民政府与哈尔滨工程大学签署了《共建哈尔滨工程大学青岛校区框架协议》，将在青岛西海岸新区建设哈尔滨工程大学青岛校区，主要建设“四院一园”，即哈尔滨工程大学 (青岛学院)、国际联合学院、校企联合学院、青岛研究院和青岛船舶产业园。
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