根据南京医科大学最新招生计划数据查询，南京医科大学开设专业有法医学、基础医学、英语、预防医学、卫生检验与检疫、应用统计学、公共事业管理、劳动与社会保障、药学、临床药学等，具体完整专业名单见下表。
| 院系设置 | 所有专业 |
|---|---|
| 基础医学院 | 法医学，基础医学 |
| 外国语学院 | 英语 |
| 公共卫生学院 | 预防医学，卫生检验与检疫，应用统计学 |
| 医政学院 | 公共事业管理，劳动与社会保障 |
| 药学院 | 药学，临床药学 |
| 国际教育学院 | 临床医学 |
| 康达学院 | 临床医学，康复治疗学，医学影像技术，护理学，英语，医学检验技术，药学，医学信息工程，预防医学，药物制剂，公共事业管理 |
| 马克思主义学院 | |
| 护理学院 | 护理学 |
| 第四临床医学院 | 眼视光医学，临床医学 |
| 医学影像学院 | 医学影像学，医学影像技术 |
| 康复医学院 | 康复治疗学 |
| 第三临床医学院 | |
| 第二临床医学院 | |
| 第一临床医学院 | 医学检验技术，临床医学 |
| 儿科学院 | 临床医学，儿科学 |
| 口腔医学院 | 口腔医学 |
| 生物医学工程与信息学院 | 生物信息学，医学信息工程，生物医学工程 |
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