根据山东中医药大学最新招生计划数据查询，山东中医药大学开设专业有食品卫生与营养学、中医养生学、社会体育指导与管理、健康服务与管理、应用心理学、中西医临床医学、中医学、中医康复学、康复治疗学、运动人体科学等，具体完整专业名单见下表。
| 院系设置 | 所有专业 |
|---|---|
| 健康学院 | 食品卫生与营养学，中医养生学，社会体育指导与管理，健康服务与管理，应用心理学 |
| 中医学院(基础医学院) | 中西医临床医学，中医学 |
| 康复学院 | 中医康复学，康复治疗学，运动人体科学，听力与言语康复 |
| 外国语学院 | 英语 |
| 管理学院 | 信息管理与信息系统，公共事业管理，市场营销，法学 |
| 药学院(天然药物研究所) | 药学，中药资源与开发，制药工程，中药学，中草药栽培与鉴定，药物制剂 |
| 国际教育学院 | 药学，护理学，中医学，中药学，生物医学工程 |
| 第二临床医学院 | |
| 理工学院 | 生物医学工程，计算机科学与技术，数据科学与大数据技术 |
| 护理学院 | 护理学(含英语方向、老年护理方向、康复护理方向) |
| 体育教学部 | |
| 眼科与视光医学院 | 中西医临床医学(眼视光医学方向) |
| 针灸推拿学院(针灸研究所) | 针灸推拿学 |
| 第一临床医学院 | |
| 马克思主义学院 |
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