厦门总共有16所大学，其中本科大学7所，比较好的有厦门大学、集美大学、厦门医学院等；专科学校9所，比较好的有厦门城市职业学院、厦门海洋职业技术学院等。
| 学校名称 | 学校标识码 | 主管部门 | 所在地 | 办学层次 | 备注 |
| 厦门大学 | 4135010384 | 教育部 | 厦门市 | 本科 | |
| 集美大学 | 4135010390 | 福建省 | 厦门市 | 本科 | |
| 厦门理工学院 | 4135011062 | 福建省 | 厦门市 | 本科 | |
| 厦门医学院 | 4135012631 | 福建省 | 厦门市 | 本科 | |
| 厦门华厦学院 | 4135012709 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 本科 | 民办 |
| 厦门工学院 | 4135013115 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 本科 | 民办 |
| 集美大学诚毅学院 | 4135013471 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 本科 | 民办 |
| 学校名称 | 学校标识码 | 主管部门 | 所在地 | 办学层次 | 备注 |
| 厦门海洋职业技术学院 | 4135012629 | 福建省 | 厦门市 | 专科 | |
| 厦门演艺职业学院 | 4135013767 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 专科 | 民办 |
| 厦门华天涉外职业技术学院 | 4135013768 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 专科 | 民办 |
| 厦门城市职业学院 | 4135013973 | 福建省 | 厦门市 | 专科 | |
| 厦门兴才职业技术学院 | 4135013979 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 专科 | 民办 |
| 厦门软件职业技术学院 | 4135014059 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 专科 | 民办 |
| 厦门南洋职业学院 | 4135014111 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 专科 | 民办 |
| 厦门东海职业技术学院 | 4135014112 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 专科 | 民办 |
| 厦门安防科技职业学院 | 4135014257 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 专科 | 民办 |
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