南京本科大学名单有南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、南京工业大学、南京邮电大学、河海大学、南京林业大学、南京信息工程大学等，具体名单参考以下表格。
| 序号 | 学校名称 | 省份 | 城市 | 层次 | 备注 |
| 1 | 南京大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 2 | 东南大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 3 | 南京航空航天大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 4 | 南京理工大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 5 | 南京工业大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 6 | 南京邮电大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 7 | 河海大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 8 | 南京林业大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 9 | 南京信息工程大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 10 | 南京农业大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 11 | 南京医科大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 12 | 南京中医药大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 13 | 中国药科大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 14 | 南京师范大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 15 | 南京财经大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 16 | 江苏警官学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 17 | 南京体育学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 18 | 南京艺术学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 19 | 南京工业职业技术大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 20 | 南京工程学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 21 | 南京审计大学 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 22 | 南京晓庄学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 23 | 南京特殊教育师范学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 24 | 南京森林警察学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 25 | 金陵科技学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 26 | 江苏第二师范学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 公办 |
| 27 | 三江学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 民办 |
| 28 | 东南大学成贤学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 民办 |
| 29 | 南京大学金陵学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 民办 |
| 30 | 南京理工大学紫金学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 民办 |
| 31 | 南京航空航天大学金城学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 民办 |
| 32 | 南京传媒学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 民办 |
| 33 | 南京工业大学浦江学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 民办 |
| 34 | 南京审计大学金审学院 | 江苏 | 南京 | 本科 | 民办 |
| 序号 | 名称 | 本/专 | 公/民 | 985 | 211 | 双一流 |
| 1 | 南京大学 | 本科 | 公办 | 是 | 是 | 是 |
| 2 | 东南大学 | 本科 | 公办 | 是 | 是 | 是 |
| 3 | 南京理工大学 | 本科 | 公办 | 否 | 是 | 是 |
| 4 | 南京航空航天大学 | 本科 | 公办 | 否 | 是 | 是 |
| 5 | 河海大学 | 本科 | 公办 | 否 | 是 | 是 |
| 6 | 南京师范大学 | 本科 | 公办 | 否 | 是 | 是 |
| 7 | 南京农业大学 | 本科 | 公办 | 否 | 是 | 是 |
| 8 | 中国药科大学 | 本科 | 公办 | 否 | 是 | 是 |
| 9 | 南京邮电大学 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 是 |
| 10 | 南京医科大学 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 是 |
| 11 | 南京中医药大学 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 是 |
| 12 | 南京信息工程大学 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 是 |
| 13 | 南京林业大学 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 是 |
| 14 | 南京审计大学 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
| 15 | 南京财经大学 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
| 16 | 南京工业大学 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
| 17 | 南京工程学院 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
| 18 | 江苏警官学院 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
| 19 | 金陵科技学院 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
| 20 | 南京森林警察学院 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
| 21 | 江苏第二师范学院 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
| 22 | 南京特殊教育师范学院 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
| 23 | 南京晓庄学院 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
| 24 | 南京工业职业技术大学 | 本科 | 公办 | 否 | 否 | 否 |
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