| 序号 | 学校名称 | 主管部门 | 所在地 | 办学层次 | 备注 |
| 1 | 厦门大学 | 教育部 | 厦门市 | 本科 | |
| 2 | 集美大学 | 福建省 | 厦门市 | 本科 | |
| 3 | 厦门理工学院 | 福建省 | 厦门市 | 本科 | |
| 4 | 厦门医学院 | 福建省 | 厦门市 | 本科 | |
| 5 | 厦门华厦学院 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 本科 | 民办 |
| 6 | 厦门工学院 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 本科 | 民办 |
| 7 | 集美大学诚毅学院 | 福建省教育厅 | 厦门市 | 本科 | 民办 |
厦门大学（Xiamen University），简称厦大（XMU），是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，由教育部、福建省和厦门市共建，是国家“211工程”、“985工程”重点建设高校，是国家“2011计划”牵头高校。入选“111计划”、“珠峰计划”、“卓越工程师教育培养计划”、“卓越法律人才教育培养计划”、“卓越医生教育培养计划”、国家建设高水平大学公派研究生项目，是全国31所副部级中管高校。学校由著名爱国华侨领袖陈嘉庚先生于1921年创办，是中国近代教育史上第一所华侨创办的大学，是国内最早招收研究生的大学之一，被誉为“南方之强” 。
截至2016年3月，学校占地超过9000亩。2014年7月，厦门大学马来西亚分校动工建设。校舍建筑总面积190多万平方米，图书馆馆藏纸质图书总量440多万册，固定资产总值84.55亿元，仪器设备总值超过25.29亿元。校园高速信息网络建设的规模、水平居全国高校前列并成为CERNET2的核心节点之一。
集美大学（JiMei University），是福建省重点建设高校，交通运输部与福建省、国家海洋局与福建省、福建省与厦门市共建高校，博士学位授予单位。
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