教育部门并没有说福建医科大学是一本还是二本，福建医科大学是几本只是民间说法，到底是一本还是二本要根据所在省份招生批次确定（目前高考是按照省份招生，某大学在某省是第一批次招生的话，通常说该大学是一本大学，在第二批次招生的话，通常说该大学是二本大学，既有一批又有二批招生的，通常也认为是二本大学）。
福建医科大学在福建是第一批次招生，所以我们通常认为福建医科大学是一本大学。
如果你不是福建考生，福建医科大学在你所在的省份是本科二批招生的话，你也可以说福建医科大学是二本大学。
| 类别 | 专业 |
|---|---|
| 社会学类(本) | 社会工作 |
| 外国语言文学类(本) | 英语 |
| 生物科学类(本) | 生物信息学 |
| 心理学类(本) | 应用心理学 |
| 食品科学与工程类(本) | 食品质量与安全 |
| 生物工程类(本) | 生物制药 |
| 基础医学类(本) | 基础医学 |
| 临床医学类(本) | 临床医学 麻醉学 医学影像学 临床医学（5+3一体化） 临床医学(儿科学)（5+3一体化） |
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