教育部门并没有说温州医科大学是一本还是二本大学，温州医科大学是几本只是民间说法，到底是一本还是二本要根据所在省份（市）招生批次确定（目前高考是按照省份招生，某大学在某省是第一批次招生的话，通常说该大学是一本大学，在第二批次招生的话，通常说该大学是二本大学，既有一批又有二批招生的，通常也认为是二本大学）。
温州医科大学在浙江是本科一段招生，在全国很多省市也是本科一批招生，我们通常认为温州医科大学是一本大学（自2017年开始，浙江省高考将不再文理分科，录取分普通类、艺术类、体育类进行，取消录取批次，实行分段录取）
如果你不是浙江考生，温州医科大学在你所在的省份是本科二批招生的话，你也可以说温州医科大学是二本大学。
| 类别 | 专业 |
|---|---|
| 生物科学类(本) | 生物技术 |
| 心理学类(本) | 应用心理学 |
| 生物医学工程类(本) | 生物医学工程 |
| 生物工程类(本) | 生物制药 |
| 临床医学类(本) | 临床医学 眼视光医学 精神医学 儿科学 麻醉学 医学影像学 眼视光医学（5+3一体化） 临床医学（5+3一体化） 临床医学中外合作办学 放射医学 临床医学（5+3一体化，儿科学方向） |
| 口腔医学类(本) | 口腔医学 |
| 公共卫生与预防医学类(本) | 预防医学 |
| 中医学类(本) | 中医学 |
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