教育部门并没有说南京中医药大学翰林学院是二本还是三本，南京中医药大学翰林学院是几本只是民间说法，到底是二本还是三本要根据所在省份（市）招生批次确定。（目前高考是按照省份招生，某大学在某省是第二批次招生的话，通常说该大学是二本大学，在第三批次招生的话，通常说该大学是三本大学，既有二批又有三批招生的，通常也认为是三本大学。）
根据公开信息可知：
南京中医药大学翰林学院在江苏是第二批次招生，所以我们通常认为南京中医药大学翰林学院是二本大学。（江苏从2017年开始，二批三批合并为二批招生）
如果你不是江苏考生，南京中医药大学翰林学院在你所在的省份是本科三批招生的话，你也可以说南京中医药大学翰林学院是三本大学。
| 类别 | 专业 |
|---|---|
| 经济与贸易类(本) | 国际经济与贸易 |
| 心理学类(本) | 应用心理学 |
| 化工与制药类(本) | 制药工程 |
| 生物工程类(本) | 生物制药 |
| 中医学类(本) | 针灸推拿学 中医学 中医学（中医全科医学） |
| 中西医结合类(本) | 中西医临床医学 |
| 药学类(本) | 药事管理 药学 药物制剂 |
| 中药学类(本) | 中药学 中药资源与开发 |
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