衢州学院设有本科专业包括视觉传达设计、音乐学（师范）、机械设计制造及其自动化、土木工程、建筑学、电气工程及其自动化、化学工程与工艺、环境工程、材料科学与工程、高分子材料与工程、新能源材料与器件、材料成型及控制工程、机械电子工程、机器人工程、智能制造工程、自动化、物联网工程、数据科学与大数据技术、人工智能、学前教育（师范）、小学教育（师范）、英语（师范）、工程管理、人力资源管理、电子商务、互联网金融、旅游管理与服务教育、数学与应用数学（师范）、汉语言文学（师范）、商务英语，共计27个专业。
此外，衢州学院还设有专科专业，包括应用化工技术、机械制造与自动化、建筑设计技术、建筑工程技术、电气自动化技术、计算机应用技术、物流管理、人力资源管理、商务英语、学前教育（师范）等10个专业。
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