1949年皖北宿县区师范学校创办，首任校长裴干元，于1950年更名为皖北区宿县师范学校，1952年更名为安徽省宿县师范学校。
1977年宿县地区师范学校与安徽大学宿县地区师范专科班（新设）合署。
1979年安徽大学宿县地区师范专科班更名为安徽师范大学宿州专科学校。
1983年宿县地区师范学校更名为宿州师范专科学校，为三年制师范专科学校。
2002年宿州市农业干部学校并入。
2004年宿州师范专科学校升格为普通本科院校，更名为宿州学院。（2004年5月17日，国家教育部正式批准宿州师范专科学校升格改建为本科层次的普通高校“宿州学院”，改变了宿州市无一所本科院校的历史，学校首批自主招生5个专业，分别是汉语言文学、数学与应用数学、应用化学、计算机科学与技术、电子信息工程。）
2009年10月，安徽省教育厅、财政厅批准宿州学院成为安徽省首批示范应用型本科高校立项建设单位，并于2013年8月顺利通过项目验收。
2014年4月，宿州学院顺利通过教育部本科教学工作合格评估。
2015年11月，宿州学院获批为安徽省高等教育振兴计划“地方应用型高水平大学建设”项目立项建设高校。
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