上海海事大学现有临港校区、港湾校区、民生路高恒大厦等3个校区。
其中，临港校区是目前学校办学主体所在地，于2008年10月基本建成，校园占地面积133万余平方米，总建筑面积60万平方米；港湾校区是学校继续教育、中等职业教育主要办学地。民生路高恒大厦位于浦东大道1608号，总建筑面积33573.87㎡。
有三个校区，第1个在浦东大道民生路海事大学本部，第二个在浦东大道金桥路校区，第三个在上海临港新城新校区，也是三个校区中最大的。
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