沈阳药科大学有21个本科专业，涵盖了十多种门类，例如药学、中药学、药剂学、药理学、生物工程、制药工程、临床药学、药学制剂、中药制药、中药分析学、应用化学、企业管理、生物化工、毒理学、分析化学、药物化学、药物分析学等等
药学类、药学(英语强化班)、药学(日语强化班)、制药工程、环境科学、应用化学、药物化学、中药学类、中药学(日语强化班)、生物工程类、临床药学、生物制药(生命基地班)、工商管理类、药事管理、生物医学工程、生物医学工程(中外合作办学)、医疗产品管理、食品科学与工程类、药学(理科基地班)。
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