一系 船舶工程学院
二系 航天与建筑工程学院
三系 动力与能源工程学院
四系 自动化学院
五系 水声工程学院
六系 计算机科学与技术学院
七系 机电工程学院
八系 信息与通信工程学院
九系 经济管理学院
十系 材料科学与工程学院
十一系 理学院
十二系 外语系
十三系 人文社会科学学院
十四系 国际合作与教育学院
十五系 核学院
十六系 国防教育学院
其中软件学院与国家保密学院在计算机学院下
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