公办。
福建医科大学创建于1937年，是我国建校较早的公立本科医学院校之一。80多年来，学校秉承“勤奋、严谨、求实、创新”的校训，砥砺“改善国民卫生的先锋，东南医药界的柱石”的初心，形成了“以人为本、求是至臻”的办学理念和“自强不息、追求卓越”的学校精神，孕育了“崇真向善、精诚致远”的校风、“厚德敬业”的教风和“博学笃行”的学风，推动学校各项事业不断向前发展。
考生及家长在选择大学的时候，民办还是公办也是考虑在内的因素之一。一般来说，公办大学的社会认可度比较高，另外在学费方面是低于民办大学的。
公办大学有中央财政或地方财政经费支持，学费通常较便宜，一般5000元/年左右，公办大学中也有一些中外合作的专业，收费可能比较高，家长在选择的时候也要了解清楚。民办大学是社会企业、社会团体、个人等举办的大学，是没有中央财政活地方财政经费支持的，所以学费比较贵，一般在10000-30000/年左右。
但是民办大学也是正规大学，是受国家认可的，毕业证、学位证等都是在学信网可查的，国家也鼓励社会资本参与办学。
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