公办大学和民办大学毕业证本质上没有太大区别，但是一些民办学校会在毕业证上多一个盖章。也就是说，公办和民办毕业证都是教育部统一发放毕业证，是国家认可的文凭和学历，在网上能查到。除此之外，民办本科与公办本科在经费、生源、学费、教学等方面有所差异。1、经费来源不同：民办大学一般由非地方或者中央政府投资，全部或者部分的依靠学生的学费来维持大学的经营而非公共资金，而公办大学是国家组建的大学，国家提供部分资金建立，经费全部来自国家拨款。2、生源选择和学费标准不同：民办大学的学费比公立大学的高，校方有权自主选择生源，而公办大学的学费以国家规定为准，相比民办大学较低。3、教学方向不同：民办大学依托市场生存,设立课程面对市场需求,而公半大学承担国家高等教育的使命,偏重基础学科的研究和教学。
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