休斯顿有多所大学，其中比较知名的有：
休斯顿大学。该校成立于1927年，位于休斯顿市中心地区，是一所公立大学，学科涵盖自然科学、财经、法律、工程学、管理学、环境、建筑、教育、旅游、农林、艺术、体育、新闻传播、信息科学、医学、语言等领域。
莱斯大学。该校是休斯顿最高学府，发展非常好，治学严谨，管理体系先进，在建筑风格、校园环境等方面也非常好，并且给学生提供足够丰厚的奖学金。
贝勒医学院。该学校的生物医药学研究在世界遥遥领先。
此外，还有赫斯顿学院、普林斯顿大学、德州大学奥斯汀分校、西南医学中心等大学。
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