复旦大学和南京大学都是中国的顶尖高校，两所大学各有其优势。
复旦大学位于上海市，前身是1905年创办的复旦工学，学校目前共有邯郸、枫林、江湾、张江四个校区，设有本科专业79个，开设有35个院系，拥有75个硕士点，41个博士点，35个博士后流动站，拥有30个国家重点学科。在学科评估中，复旦大学一共有38个学科参评，获得A类学科的共计23个，其中哲学、理论经济学、政治学、中国史、数学都被评为A+，全国排名第五。
南京大学位于江苏省南京市，前身是1902年创办的三江师范学堂，学校目前共有四个校区，33个院系，设有本科专业89个，共有33个硕士点，44个博士点，38个博士后流动站，拥有21个国家重点建设学科。在学科评估中，南京大学一共有21个学科获得A类，其中天文学、地质学、图书情报与档案管理三个专业获得A+的好成绩，全国排名第六。
总的来说，复旦大学和南京大学都是中国的高等教育机构中的佼佼者，两所大学各有其特色和优势。具体选择哪所大学，需要根据个人的兴趣和需求来决定。
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