清华大学的前身清华学堂始建于 1911 年，1912 年更名为清华学校。
1928 年更名为国立清华大学。
1937 年抗日战争全面爆发后南迁长沙，与北京大学、南开大学组建国立长沙临时大学，1938 年迁至昆明，改名为国立西南联合大学。
1946 年迁回清华园，设有文、法、理、工、农等 5 个学院、26 个系。
1952 年全国高等学校院系调整后，清华大学成为一所多科性工业大学，重点为国家培养工程技术人才，被誉为“红色工程师的摇篮”。改革开放以来，清华大学逐步确立了建设世界一流大学的长远目标，进入了蓬勃发展的新时期。学校先后恢复或新建了理科、经济、管理和文科类学科，并成立了研究生院和继续教育学院。
1999 年，中央工艺美术学院并入，成立清华大学美术学院。
2012 年，中国人民银行研究生部并入，成为清华大学五道口金融学院。在国家和社会的大力支持下，通过实施“211 工程”“985 工程”，开展“双一流”建设，清华大学在人才培养、科学研究、社会服务、文化传承创新、国际合作交流等方面都取得了长足进展。
目前，清华大学共设 21 个学院、59 个系，已成为一所设有理学、工学、文学、艺术学、历史学、哲学、经济学、管理学、法学、教育学和医学等 11 个学科门类的综合性、研究型大学。
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