中国海事大学建于1909年。
1909年晚清邮传部上海高等实业学堂（南洋公学）船政科开创了我国高等航海教育的先河。
1912年成立吴淞商船学校，1928年更名为吴淞商船专科学校。
1950年吴淞商船专科学校和上海交通大学航业管理系合并，成立上海航务学院。
1959年交通部在沪组建上海海运学院。从2000年开始，学校实行由上海市和交通部共建，以上海市管理为主的体制。
2004年教育部批准上海海运学院更名为上海海事大学。
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