重庆西南大学现在有3个校区。
北碚校区：为西南大学主体，这里住着博士后、博士硕士研究生、本科第一批及提前批次学生、少数民族预科生和留学生，可划分为北区和南区，在校生近5万人，其中博士、硕士研究生11000余人，本科学生30000余人，占地面积9630余亩，建筑面积约166万平方米。
荣昌校区：截至2016年5月，荣昌校区是西南大学“一校两地”办学格局中的重要组成部分，现为多学科高水平特色校区，国家卓越农林人才教育培养计划试点高校。
江北校区即应用技术学院。西南大学应用技术学院是西南大学从事全日制应用技术本科教育的学院，是西南大学下属的32个二级学院之一。学院设有七个本科专业，仅在重庆市内招生，其录取分数线为二本控制线。
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