南京工程学院电气自动化专业与国外合作自动化专业之间可能存在以下一些区别：
课程设置：南京工程学院电气自动化专业的课程设置可能更加针对国内的教育体系和行业需求，注重基础理论和实践技能的培养。而国外合作自动化专业可能更加注重国际化、综合性和前沿技术的教学，涵盖更广泛的课程内容。
教学方法：南京工程学院电气自动化专业的教学方法可能更加注重理论教学、实验教学和工程实践，培养学生的实际操作能力。而国外合作自动化专业可能更加注重项目实践、团队合作和实际工程案例的研究。
学术资源：国外合作自动化专业可能能够提供更多国际化的学术资源，包括国外教授的讲座、实习和交流机会，以及与国外大学的合作项目。而南京工程学院电气自动化专业的学术资源可能更加偏向于国内的学术研究和产业合作。
就业前景：国外合作自动化专业可能更容易获得国际化的就业机会和跨国公司的工作机会。而南京工程学院电气自动化专业的学生更多地面向国内市场就业，可能更容易适应国内的行业需求和就业市场。
需要注意的是，具体的区别可能因不同的学校和合作项目而异。如果您对具体学校或项目有兴趣，建议您进一步了解该学校或项目的课程设置、教学方法、学术资源以及就业前景等方面的信息。
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