主要有以下几点：
1.地理位置：东北师大本部位于沈阳市沈河区文化路3号，而净月校区位于大连市甘井子区净月经济技术开发区。两个校区之间相隔约370公里。
2.院系设置：东北师大本部设有文、史、哲、教育、经济、法学、政治、社会学、体育、音乐等10个学院；净月校区则设有文学院、历史文化与旅游学院、教育科学学院、人文学院、经济与管理学院、政法学院、数学与统计学院、物理科学与技术学院、化学与材料科学学院、计算机科学与工程学院、生命科学学院、外国语学院、音乐学院等13个学院。
3.学科专业：两个校区的专业设置也有所不同，东北师大本部重点发展教育、文学、历史、哲学等社科领域的学科，同时也涵盖了理学、法学、经济学等方面；净月校区则不仅有社科领域的学科，还增加了理、工、管、艺等领域的学科。
4.校园环境：东北师大本部占地面积较大，校园环境良好，建筑物多为欧式风格，学生参加各种活动的场所也比较多；净月校区为现代化的校园，设有各式各样的功能室、实验室，同时也有大片绿化带和运动场地供同学们使用。
总之，东北师大本部和净月校区各有特色，学生可以根据自己的兴趣和专业方向选择适合自己的校区。
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