复旦大学现在有4个校区，分别为：邯郸路校区、枫林校区、桃仙张江校区和新江湾城新校区。其校区介绍如下：
● 邯郸路校区：是复旦大学的主校区，通称“本部”，因位于邯郸路220号而得名。校区在杨浦区，靠近五角场，1922年私立复旦大学的大学部从徐家汇李公祠迁入，1952年院系调整后，邯郸校区校园逐渐向东、向南扩展。现在邯郸校区占地922297平方米，合1383亩，分为东、南、北、中四个地区。
● 枫林校区：位于上海市徐汇区医学院路138号，是原上海医科大学的校址。校园占地面积约为1.94平方公里，北面是枫林路，南面是零陵路，东面是肇嘉浜路，西面是斜土路。枫林校区是复旦大学的理科校区，包括基础医学院、药学院、公共卫生学院、护理学院、生物医学研究院、脑科学研究院、神经科学研究院、生物多样性与生态工程研究院、代谢与整合生物学研究院、人类表型组研究院、发育生物学研究所、医学神经生物学国家重点实验室、聚合物分子工程国家重点实验室、医学神经生物学国家重点实验室、代谢与整合生物学国家重点实验室、生物医学研究院、脑科学研究院、神经科学研究院、生物多样性与生态工程研究院、代谢与整合生物学研究院、人类表型组研究院、发育生物学研究所、医学神经生物学国家重点实验室、聚合物分子工程国家重点实验室、医学神经生物学国家重点实验室、代谢与整合生物学国家重点实验室等院系和科研机构。
● 桃仙张江校区：位于上海市浦东新区张江高科技园区张衡路825号，是复旦大学的药学院、微电子学院、信息科学与工程学院所在地。
● 新江湾城新校区：位于上海市杨浦区新江湾城西北
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