济宁医学院好些。
两校都是山东省属公立普通二本院校。济宁医学院的精神卫生学科在省内是翘楚，学校拥有山东省唯一一家省级三级甲等精神卫生专科医院、有山东省医学院校唯一一个省高校司法鉴定中心。全国排名580名左右；
济宁学院前身是济宁师范学校，后改名济宁师范专科学校，2007年3月济宁师范专科学校升格为济宁学院。
2008年11月，山东省曲阜师范学校并入济宁学院。
2012年10月，学校实行“省市共建、以省为主”的管理体制，成为省属高校。全国排名720名左右。
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