上海海事大学前身为创建于1909年7月的晚清邮传部上海高等实业学堂船政科，开创了我国高等航海教育的先河。
1912年成立吴淞商船学校，1933年更名为吴淞商船专科学校。
1959年交通部在沪组建上海海运学院。
2004年经教育部批准更名为上海海事大学。
为更好地服务上海国际航运中心建设和国家航运事业发展，根据上海市高校布局结构调整规划，2008年上海海事大学主体搬迁临港新城(现上海自贸区临港新片区)。
2019年学校成功举行110年校庆系列活动。
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