南京中医药大学是江苏省属重点院校，是一本，个别专业在个别省份是二本。
二本专业的有：中西医临床医学5年
针灸推拿学5年
护理学5年
以下专业都为4年制
康复治疗学
药学
制药工程
中药资源与开发
国际经济与贸易
市场营销
公共事业管理
信息管理与信息系统
电子商务
电子商务（国际课程实验班）
护理学
英语
计算机科学与技术
计算机科学与技术（国际课程实验班）
应用心理学
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