吉首大学吉首市校区的专业设置与其他校区相同，包括文、理、工、管、法、教育、艺术等多个学科门类。
以下是吉首大学吉首市校区的部分专业列表：
电子信息工程
计算机科学与技术
通信工程
机械设计制造及其自动化
软件工程
物联网工程
电气工程及其自动化
自动化
数学与应用数学
物理学
化学
生物科学
环境科学与工程
土木工程
工商管理
会计学
法学
英语
汉语言文学
新闻传播学
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