理工大学地铁站到花牌坊地铁站的换乘方法如下：
从理工大学地铁站乘坐地铁2号线（内环）往西直门方向，经过4站后到达西直门地铁站。
在西直门地铁站下车后，换乘地铁13号线（东直门方向），乘坐3站后到达车公庄地铁站。
在车公庄地铁站下车后，换乘地铁6号线（金安桥方向），乘坐2站后到达花园桥地铁站。
在花园桥地铁站下车后，换乘地铁10号线（劲松方向），乘坐1站后到达花牌坊地铁站。
总共需要换乘3次，行程大约需要50分钟左右。需要注意的是，具体的乘车时间和路线可能会受到交通状况和客流量等因素的影响，建议您提前留出充足的时间。
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