目前的主要区别在于是否招收本科生，苏州校区根据已有消息显示是仅招研究生的，自然也无法用高考的批次线来划分。
苏州校区目前是仅招收研究生的校区，其意义在于将完整的高教体系带到苏州，加强产学研合作，实现共赢，是无法横向和东南大学本校区比较的。
东南大学，简称“东大“，本部位于南京 ，是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，中央直管副部级建制，是国家“双一流”、“985工程”、“211工程”重点建设高校 。
东南大学拥有十一个双一流建设学科，包括材料科学与工程、电子科学与技术、信息与通信工程等，其中土木、建筑、交通类学科群一直都是A+的水平，电子信息也是强势学科，保持A的水平。近年来兴起的智能建造、智能医学工程、智能感知工程、机器人工程、人工智能专业、网络空间安全专业等专业也都在飞速发展，且位于全国发展前列。此外还有仪科、自动化、电气（这些也是归大电类）以及材料等强势工科、能源与环境、机械、化工等实力不差的传统工科，都在不断发展进步。
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