有区别。
1）地理位置不同。 南林淮安校区位于江苏省淮安市,而校本部位于南京市玄武区。
2）建校时间不同。 南林淮安校区建校时间是2017年,而校本部建校时间是1902年。 南林淮安校区与校本部的授课老师和毕业证书都是一样的。南林淮安校区的学校老师为南京林业大学南京本部校区老师，老师每周乘校车来回授课。
3）招收生源不同。南林淮安校区只招江苏省内考生。
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