医科大学和中医药大学较根本的区别是方向不同，面向考生招生的类别也有重大的区别。
医科大学在招生过程中，它设置的是临床医学，口腔医学，眼视光医学，麻醉学，妇科学，儿科学，助产，医学检验技术，医学实验技术，基因编程，医学，特种医学，航空航天医学等。而且是面向理工类考生招生，它在面向文史类考生的中，主要有药事管理，护理学等。
中医药类大学面向理工类，文史类都设置有招生计划，而且主要面向文史类考生设置有招生计划，它的设置有中医学，中药学，制药工程，中医药栽培技术，中西结合临床医学等，还有药剂学，护理学等。
所以，医科率大学和中医药类大学的区别还是明显的，在我国，比较的医科类大学有北京协和医学院，清华大学，北京大学，上海交通大学医学院，四川大学华西医学院，中南大学湘雅医学院，空军军医大学，海军军医大学，陆军军医大学，西安交通大学医学院，厦门大学医学院，河北医科大学，中国医科大学，首都医科大学，大连医科大学，温州医科大学，同济大学医学院，复旦大学医学院，华中科技大学医学院，哈尔滨医科大学，医科大学，天津医科大学等。
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