一、培养目标不同
医学学硕主要培养研究型人才，锻炼学生的科研能力，如果学生毕业之后想留在大学任教或者做研究，就可以选择考医学学硕；而医学专硕主要培养实践型人才，学生毕业之后，主要在医院就职。
二、学习环境不同
医学学硕的学习环境大多数在实验室，只有半年的时间是临床学习；而医学专硕基本上三年都要在医院进行实习。
三、证书不同
医学学硕的学生，毕业之后只有毕业证和学位证，没有其他证书；而医学专硕的学生毕业之后，不仅可以拿到毕业证，还可以拿到规培证。
四、入学难度不同
医学学硕的公共课一般考英语一和数学一，难度较大；而医学专硕的公共课一般考英语二和数学二，难度相对较低。
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