一本贯通和本科在学制、起点、入学方式、报考条件等方面有所不同。
1、学制不同：专本贯通即统招专升本，也是专接本，学制为5年，前3年在专科院校学习，后2年在本科院校学习；本科即统招本科，一般学制为4年，医学类、建筑类专业学制为5年。
2、起点不同：专本贯通起点为高职专科层次报名；本科起点一般为高中应往届毕业生。
3、入学方式不同：专本贯通入学是由各省考试院组织实施安排的，各省考试时间不相同；而本科入学是由统一安排的，由各省市具体实施，考试时间统一。
4、考试科目不同：专本贯通考试科目为大学语文/高等数学、大学英语、思想政治、计算机应用基础和专业综合课程等；本科入学考试为高考规定考试科目，考试科目与各省实施新高考方案有关，考试科目不同。主要考试语文、外语、数学，以及文综、理综或学业水平考试。
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