东京都内有12间国立大学，1间公立大学和超过100间私立大学，主要有：
1.国立大学包括：
东京大学
一桥大学
东京工业大学
政策研究大学院大学
御茶水女子大学
东京学艺大学
东京医科牙科大学
东京农工大学
东京外国语大学
东京海洋大学
东京艺术大学
电气通信大学
2.东京都只有一所都立大学：
首都大学东京
3.较著名的私立大学有：
早稻田大学
庆应义塾大学
明治大学
法政大学
中央大学
立教大学
上智大学
东京理科大学
学习院大学
拓殖大学
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