京师大学堂是北京大学之源，戊戌变法之时，京师大学堂设立之初，行驶了部分国子监的功能，第一是新式学校中的最高学府，第二兼备管理各地新式学校的功能。
京师大学堂的教学内容虽然向西学开放，但是仍然奉孔子为圣人，把经学科作为第一学科，将研究院叫做通儒院，目的是强调儒家文化的正统地位，因此，京师大学堂既是一个中西文化融合的重要载体，也是国子监的一种现代延续。
从知识体系上来讲，京师大学堂之后，特别是新文化运动开始以后，西学在北京大学和整个社会都占据了强势的地位，儒家文化渐渐的退出主流地位。蔡元培在任国民政府教育部长时曾明令禁止全国的中小学校读经，后来北大也取消了经学科，这代表了他当时作为北大的校长对于儒家文化的态度。蔡元培校长也曾经提出用美育代替宗教，希望美育成为新民的灵魂。
而如果在北大的校园设立孔子雕像的话，就会毁了北大“五四”的新道统，没有北大就没有五四运动，而五四运动有两个重要的历史贡献，首先，传播了民主科学和马克思主义，其次，打压了儒家的文化。如果在北大设立孔子雕像的话就是意味着否定了当时的历史共享，从而导致对于前者的间接否定。
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