有食品科学与工程专业，动物医学专业，食品质量与安全专业，动物科学专业，农学专业，植物保护专业，自动化专业。
1、学院国家级特色专业：园艺、农林经济管理、动物科学、中药资源与开发、食品科学与工程、家政学、动物医学。
2、学院国家级专业综合改革试点专业：动物医学、植物保护。
3、吉林省特色专业：动物医学、农业资源与环境 、动物科学、中药资源与开发、农林经济管理、食品科学与工程、园艺、家政学、应用化学、生物技术、植物保护、农学、生物工程。
4、吉林省品牌专业：植物保护、动物科学、动物医学、食品科学与工程、农学、农林经济管理、农业资源与环境、生物工程、园艺。
5、卓越农林人才教育培养计划改革试点专业：植物保护、动物医学、食品科学与工程、动物科学、农业资源与环境、农学、园艺、农林经济管理。
吉林农业大学设有15个学院，1个研究生院和1个直属教学部门。拥有7个博士后科研流动站，9个博士学位授权一级学科，43个博士学位授权二级学科，18个硕士学位授权一级学科，81个硕士学位授权二级学科，9个硕士专业学位授权类别，15个硕士专业学位授权领域；1个国家重点（培育）学科，3个部委级重点学科，13个省级特色高水平学科。有63个本科专业。有教职工1884人，全日制在校生22922人。
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