福建农业职业技术学院王牌专业有园林技术、现代农业、农产品商贸流通服务、智慧农业等，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
《高等职业教育创新发展行动计划（2015—2018 年）》项目认定骨干专业：连锁经营管理、园林技术
省级特色专业群：园林技术、现代农业、农产品商贸流通服务、智慧农业
省级产教融合示范专业：园艺技术、畜牧兽医
骨干特色专业：园林技术、畜牧兽医、农业生物技术、连锁经营管理、计算机应用技术
| 院系名单 | 专业名称 | 本专科 |
|---|---|---|
| 软件学院 | 软件技术 | 专科 |
| 经济管理学院 | 国际商务 | 专科 |
| 大数据与审计 | 专科 | |
| 金融服务与管理 | 专科 | |
| 统计与会计核算 | 专科 | |
| 财富管理 | 专科 | |
| 跨境电子商务 | 专科 | |
| 连锁经营与管理 | 专科 | |
| 大数据与会计 | 专科 | |
| 现代物流管理 | 专科 | |
| 市场营销 | 专科 | |
| 相思岭乡村旅游产业学院 | 休闲农业经营与管理 | 专科 |
| 中小企业创业与经营 | 专科 | |
| 园艺园林学院 | 工程造价 | 专科 |
| 建筑工程技术 | 专科 | |
| 园艺技术 | 专科 | |
| 园林技术 | 专科 | |
| 建设工程管理 | 专科 | |
| 茶艺与茶文化 | 专科 | |
| 花卉生产与花艺 | 专科 | |
| 风景园林设计 | 专科 | |
| 现在农业工程学院 | 农业生物技术 | 专科 |
| 食品智能加工技术 | 专科 | |
| 茶艺与茶文化 | 专科 | |
| 环境工程技术 | 专科 | |
| 食品检验检测技术 | 专科 | |
| 食品质量与安全 | 专科 | |
| 现代农业技术 | 专科 | |
| 通信学院 | 现代通信技术 | 专科 |
| 移动应用开发 | 专科 | |
| 互联网金融学院 | 网络营销与直播电商 | 专科 |
| 金融科技应用 | 专科 | |
| 动物科学学院 | 动物医学 | 专科 |
| 宠物养护与驯导 | 专科 | |
| 畜牧兽医 | 专科 | |
| 宠物临床诊疗技术 | 专科 | |
| 动物防疫与检疫 | 专科 | |
| 信息工程学院 | 虚拟现实技术应用 | 专科 |
| 计算机网络技术 | 专科 | |
| 移动商务 | 专科 | |
| 计算机应用技术 | 专科 | |
| 动漫制作技术 | 专科 | |
| 物联网应用技术 | 专科 | |
| 电子商务 | 专科 | |
| 大数据技术 | 专科 |
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