安庆医药高等专科学校王牌专业有护理、药品质量与安全、药学等，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
高等职业教育创新发展行动计划（2015—2018 年）认定骨干专业：药品质量与安全
安徽省综合改革试点专业：护理、药品质量与安全、药学
中央财政支持专业：康复治疗技术、药学
省级特色专业：护理、康复治疗技术、药学
省级骨干专业：护理、临床医学
市级一流专业：护理
安庆市高水平建设专业：药学
校传统及重点专业：临床医学
| 院系名单 | 专业名称 | 本专科 |
|---|---|---|
| 药学系 | 药物制剂技术 | 专科 |
| 药学 | 专科 | |
| 药品经营与管理 | 专科 | |
| 中药学 | 专科 | |
| 药品生产技术 | 专科 | |
| 生物制药技术 | 专科 | |
| 药品质量与安全 | 专科 | |
| 保健食品质量与管理 | 专科 | |
| 食品检验检测技术 | 专科 | |
| 护理系 | 护理 | 专科 |
| 助产 | 专科 | |
| 老年保健与管理 | 专科 | |
| 临床医学系 | 康复治疗技术 | 专科 |
| 医学影像技术 | 专科 | |
| 医学检验技术 | 专科 | |
| 中医学 | 专科 | |
| 临床医学 | 专科 | |
| 公共卫生管理 | 专科 | |
| 中医康复技术 | 专科 | |
| 预防医学 | 专科 |
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