云南中医药大学王牌专业有中医学、中药学、制药工程、针灸推拿学、中西医临床医学等，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
1、一流本科专业建设点（国家级+省级）
2019-2021年度一流本科专业建设点（国家级+省级）
| 序号 | 专业名称 | 级别 | 入选批次 |
| 1 | 护理学 | 国家级 | 第一批 |
| 2 | 中医学 | 国家级 | 第二批 |
| 3 | 中药学 | 国家级 | 第二批 |
| 4 | 药学 | 国家级 | 第三批 |
| 5 | 中医学 | 省级 | 第一批 |
| 6 | 中药学 | 省级 | 第一批 |
| 7 | 针灸推拿学 | 省级 | 第一批 |
| 8 | 中西医临床医学 | 省级 | 第一批 |
| 9 | 药学 | 省级 | 第一批 |
| 10 | 康复治疗学 | 省级 | 第二批 |
| 11 | 傣医学 | 省级 | 第二批 |
| 12 | 医学信息工程 | 省级 | 第三批 |
| 13 | 制药工程 | 省级 | 第三批 |
| 14 | 食品质量与安全 | 省级 | 第三批 |
| 15 | 中药资源与开发 | 省级 | 第三批 |
| 16 | 公共事业管理 | 省级 | 第三批 |
2、国家级特色专业：中药学、中医学
3、国家综合改革试点专业：中医学
4、云南省级特色专业：中医学、中药学、制药工程、针灸推拿学、中西医临床医学
5、云南省综合改革试点专业：中医学、中药学、针灸推拿学
学院 | 专业 | 学制 |
|---|---|---|
云南中医药大学基础医学院 | 医学检验技术 | 四年 |
云南中医药大学第一临床医学院（第一附属医院） | 中医学 | 五年 |
中西医临床医学 | 五年 | |
中医儿科学 | 五年 | |
云南中医药大学护理学院 | 护理学 | 四年 |
云南中医药大学第二临床医学院（针灸推拿康复学院、第二附属医院及云南省血栓病医院） | 针灸推拿学 | 五年 |
中医康复学 | 五年 | |
康复治疗学 | 四年 | |
中医养生学 | 五年 | |
云南中医药大学人文与管理学院 | 市场营销 | 四年 |
公共事业管理 | 四年 | |
应用心理学 | 四年 | |
云南中医药大学中药学院 | 中药学 | 四年 |
中药资源与开发 | 四年 | |
药物制剂 | 四年 | |
制药工程 | 四年 | |
药学 | 四年 | |
中草药栽培与鉴定 | 四年 | |
食品科学与工程 | 四年 | |
食品质量与安全 | 四年 | |
云南中医药大学民族医药学院 | 傣医学 | 五年 |
云南中医药大学信息技术学院 | 计算机科学与技术 | 四年 |
医学信息工程 | 四年 |
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